Нью-Йорк окутан тьмой, которую принес Шреддер со своим зловещим Кланом Футов, держащим в железных тисках всех, от полицейских до политиков. В такие мрачные времена из глубин канализации появляются...

Шреддер, с помощью остатков Клана Фут и профессора Стокмана, разрабатывает хитроумный план побега во время своей перевозки в другую тюрьму. Эйприл узнает о предстоящем побеге, просматривая файлы...